Juan José Ruiz trabaja en el Equipo de Salud Mental de Distrito de Úbeda (Jaén), perteneciente al Hospital San Juan de la Cruz de Úbeda. Es autor de diversas obras, como Protocolos de evaluación e intervención multimodal de los trastornos mentales (2002) o Manual de psicoterapia cognitiva (2002), ambas obras escritas  en colaboración  con J,J. Cano.